Hola Manisera:
El tramo entre El Cairo y Luxor pasa por lo que llaman el Egipto Medio, zona considerada "peligrosa", lo que seguramente obligará a que tengas que ir en convoy o con escolta policial aq partir de un punto (esto es un engorro horrible) Otra cosa es que encuentres algún taxista que quiera hacer ese recorrido, al ser tan largo no creo que tengas muchos candidatos pq normalmente hacen recorridos medianamente cercanos a su lugar de residencia, además esa zona no creo que quieran hacerla.
De todas formas puedes consultar con la Oficina de Turismo de Egipto, si eres de Madrid la cosa es tan fácil como acercarte y preguntar, si eres de fuera puedes enviarles un e-mail o telefonearles (no se si esta última opción será mas complicada), aunque he de decir que muchas veces desconocen ciertos aspectos sobre que o que no visitar, pero supongo que las condiciones de seguridad y las normas a seguir si las sabrán. Tb puedes informarte en alguna agencia de viajes que ofrezca viajes a Egipto.
En cuanto al alojamiento pues dependerá de las fechas en las que viajes y en el tipo de alojamientos que busques porque, lógicamente, si vas sin reserva tendrás que conformarte con lo que encuentres y ya sabemos que las categorÃas de los hoteles en Egipto distan mucho de parecerse a las nuestras. Encontrar seguro que encuentras donde alojarte, el problema es el sitio.
Es lo que se me ocurre decirte. Si tienes mas dudas aquà estamos para lo que podamos ayudarte